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但是，过度依靠化学药杀虫防霉也引起了许多问题，如人畜累积毒、环境和粮食污染及害虫抗药性逐渐加强。有调查显示我国40个粮库所采集的米象、谷蠹、玉米象、锯谷盗、赤拟谷盗和锈赤扁谷盗等６个品系的77个虫样，其中抗性虫样约占62％，主要集中在河北、湖北、四川和广东等地。对于害虫抗性的形成，研究者提出了许多理论，如基学说、变学说等，但大都认为多次使用同种药剂会强化害虫对药剂的适应性。目前，因具有良好的扩散性、杀虫效果好、操作简单、成本低的优势，我国约90％的粮库采用磷氢熏蒸防治储粮害虫，其有的地位。

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比较空气、氮气、二氧化碳在研究了玉米使用不同气体（空气、98％Ｎ２、40％ＣＯ２）储藏期间其品质变化规律，结果显示：玉米98％N2和40％CO2气调储藏比常规储藏有明显抑制玉米品质劣变的效果，且CO2效果更显著。大量研究表明，二氧化碳气调储藏的效果较氮气气调储藏要好，但因二氧化碳不能现场制备，只有以购买获得，所以其成本偏高，而氮气来源简单成本低，已在我国粮库得到很好的应用。另外，对于二氧化碳气调储粮，有研究者提出，可将工业废气中的二氧化碳作为来源之一，既能得到二氧化碳，又能减少废气的排放，但这还需要大量研究和验证。目前，仍有许多因素制约气调储粮技术的发展和应用，粮仓气密性的好坏决定气调储藏效果优劣，虽然粮仓可经过改造达到密闭性要求，但增加了成本和劳动量。另外，该技术可造成低氧环境，对粮库作业人员存在生命安全问题。

5生物防治技术生物源防虫剂是利用生物活或其产生的活性物质作为杀虫药剂，包含动物源、植物源、微生物源物质或其代谢产物。生物源防虫剂具有安全、无环境污染、效果好的优点，有一定的研究价值和发展潜力。植物源杀虫剂为了解决化学药剂储粮所带来的抗药性、环境污染等影响，研究者在探究和开发新型储粮保护剂的过程中发现，有些植物的次生代谢产物是为害虫而产生的化学活性物质，具有杀虫作用。目前，研究者对植物性储粮防治剂已经进行了大量研究，取得了许多成果。有研究表明，辣椒素对稻谷中的害虫有明显的驱避和触杀作用，可有效抑制稻谷表面微生物的生长。